ミュウツーは、2009年に発売された「ポケットモンスターハートゴールド・ソウルシルバー」でも、「ハナダのどうくつ」で仲間にすることができたほか、「ポケットモンスターブラック2・ホワイト2」でも最強クラスのポケモンとして活躍している