母港は司令官の活動拠点となる。母港は艦隊を編成したり、補給・改装などの出撃前の準備を行なう、艦隊の全ての活動を行なう拠点。また、母港には、艦隊の強化・運用には欠かせない4つの戦略資材、燃料・弾薬・鋼材・ボーキサイトの備蓄数が表示される。時間経過とともに上限値まで自動補充されるが、アイテム屋から購入する事も可能