ソリッド・スネークがシャドー・モセス島の事件を解決した2年後。核搭載歩行戦車“メタルギア”の技術は世界へ拡散を始めていた。今作からプラットフォームをPS2に移行し、記憶媒体としてDVD-ROMを採用。これによりグラフィックスやシステム面での性能が向上し、要所にポリゴンデモムービーを挿入することで映画のような演出も可能になった
