XIII機関とは、特別に強い力を持つノーバディで構成されている集団。“キングダムハーツ”を得るために、配下のノーバディを使って各地で暗躍している。リーダーはゼムナス。光と闇の間にある「存在しなかった世界」に拠点となる城がある。そこでソラたちとXIII機関との最後の戦いが幕を開ける――。敵対するだけでなく時には共闘も!?(C) Disney Developed by SQUARE ENIX