入手したスキルポイントは機体ごとに蓄積されている。スキルには主に射撃や格闘などの「能力強化系」、ブーストゲージ/EXゲージの溜まり方や量を変化させる「ゲージ系」があり、「機体のコストダウン」や「スキルポイントの獲得量増加」などの特殊なものも存在する