Jリーグに新規加盟するオリジナルクラブでゲームをスタートさせた場合、ホームタウンの選択から始まり、クラブ名、エンブレム、ユニフォームをプレーヤーの好みで自由に選択することができる。これらの項目を決定した後には、監督やスカウトとの契約が待っている。その他の大きな違いとしてはJ2からのスタートとなるので、まずはJ1へ昇格することを目標にクラブ全体の底上げから行なっていく必要があるということ
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※ゲーム中のJリーグ選手は2009年6月21日時点のJリーグ登録選手を基に（株）セガが選定したものです。