序盤、不穏な動きを見せるスペクター「サレン」の陰謀を追っていくことで、本作における冒険の糸口が明らかにされていく。それをクリアすると母船「ノルマンディー」を駆って銀河全体を探検できるようになる。各地でクエストを受けてから出かけるもよし、探索を先に行なうのもよしと、自由度の高いプレイを楽しむことができる