パイロットシナリオは、アムロ編、アムロ(逆襲のシャア)編、シャア編、ガイア編、クエス編で遊ぶことができる。少数の戦力を操作するシナリオで、手軽にプレイすることができる。ゲームを進めていくことで権限が増し、多数の部隊を率いて戦うことが可能になる※画面は開発中です。(C)創通・サンライズ