授業中に突然、暴れ出したクラスメイトに突き飛ばされ学校の3階から転落してしまった主人公の石神優斗。奇跡的にかすり傷程度で済んだが、その日から“妙なモノ”が見えるようになってしまう。それは“妖（あやかし）”と呼ばれるものだった。芸能科担任の安倍彩香はなぜか石神が「見える」事を知っており、石神は安倍先生の元、「妖対策室」のメンバーとして“妖”を退治していくこととなる
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